בפרו עדיין קיימים מוקשים קבורים בשטחה, והם מהווים סיכון ממשי לאנשים שנמצאים באזורים מסוימים. לפי הערכות קיימים למעלה מ-100,000 מוקשים באזור גבול קו-המשווה של פרו. מוקשים רבים גם מצויים בגבול שבין פרו וצ'ילה. יתרה מכך, בתקופה שבה היו התקפות של פעילי המהפכה על תחנות החשמל ברחבי פרו, נטמנו סביב תחנות החשמל ומתקני תשתית חשובים אחרים מוקשים רבים על-ידי הצבא בהוראת הממשלה.

הגשמים החזקים של El Niño חושפים לעיתים את המוקשים או אף גורמים לסחיפתם ממקומם. מאז שנת 1995 דווחו 179 מקרים שבהם נהרגו אנשים כתוצאה מעלייה על מוקש, וככל הנראה נתונים אלו גבוהים הרבה יותר מהמדווח.

פרו ממשיכה לפעול לפינוי מוקשים בעיקר באזור הגבול עם אקוודור, שם נותרו מוקשים רבים בעקבות הסכסוך באזור קורדיירה דל קונדור ב-1995. נכון לעשור האחרון, פרו הצליחה לפנות אלפי מוקשים אך עדיין נותרו אזורים רבים המזוהמים במוקשים, במיוחד באזורים מרוחקים וקשים לגישה.