פשיעה ושחיתות
הונדורס משמשת, בין היתר, נקודת מעבר להברחות סמים. הפשיעה והשחיתות הן אבני הנגף העיקריות שעשויות לפגוע בהתקשרות עסקית בהונדורס.
"מלחמות הסמים והכנופיות הביאו את מדינות מרכז אמריקה להוביל את רשימת המדינות עם שיעור מקרי הרצח הגבוה בעולם. לפי דוח שפרסם האו"ם, הונדורס מובילה כמדינה עם שיעור הרצח הגבוה בעולם."
"הכנופיות בבירת הונדורס שולטות על השכונות, משתמשות בילדים לאיסוף דמי סחיטה, למכירת סמים ואפילו לביצוע מעשי רצח. מי שחומקים ממעגל האלימות הם כמה עשרות ילדים שמשחקים בקבוצת הכדורגל המקומית. אבל במדינה שבה נרצחו השנה אלף ילדים, מאמנם יודע שהוא עלול לאבד כל אחד מהם בכל רגע."
"כל בתי הסוהר בהונדורס נמצאים בשליטת האסירים. בדוח שפרסם ארגון זכויות אדם עולה כי מתקני הכליאה בהונדורס שמורים בצורה כה גרועה עד שהאסירים יכולים לברוח בכל עת. האסירים הם שקובעים את החוקים."
אסונות טבע ומוקשים
רעידות אדמה חזקות, התפרצויות של ערי געש ומפולות בוץ, מתרחשות במדינה מדי פעם בפעם, ובאזור החוף הקאריבי מכים הוריקנים וסופות טרופיות. ב-1998 החריב ההוריקן מיץ' את העיר השנייה בגודלה, סן פדרו סולה.
בתקופת מלחמת האזרחים בניקרגואה, טמנו אנשי הצבא יותר מ-50 אלף מוקשים לאורך הגבול בין ניקרגואה להונדורס. מאז 1990 נפצעו יותר מ-200 בני אדם ממוקשים שהתפוצצו באזור הגבול.